BALLView - software para edição e modelagem molecular

BALLView é um aplicativo para edição, modelagem e visualização de moléculas. É também um quadro para o desenvolvimento de funcionalidades de visualização molecular. Está é uma excelente ferramenta para oferecer ao aluno o elemento visual que falta na sala de aula. Estão disponíveis versões para GNU/Linux, Mac OS e para MS Windows. 

Download BALLView para Windows 32 bit Download BALLView para Windows 64 bit Download BALLView para MacOS X Download e instalação no GNU/Linux
Sob a licença: Licença Pública Geral GNU (GPL)
A interface do programa com uma molécula de exemplo (do próprio BALLview):

O diálogo de preferências:

Veja abaixo um pequeno vídeo demonstrativo:

Página do projeto: ballview.org

É isso.